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感染疾病診斷：生化免疫分析儀可以檢測病毒或細菌等病原體的抗原或抗體，以診斷各種感染疾病。例如，可以檢測ＨＩＶ、ＨＥＶ、ＨＢＶ等病毒，或者檢測細菌如杜倫桿菌、腸腸球菌等。

癌癥診斷：生化免疫分析儀可以檢測腫瘤標志物，如ＣＥＡ、ＣＡ１２５、ＣＡ１９９等，以輔助癌癥的診斷和療效評估。

內分泌疾病診斷：生化免疫分析儀可以檢測多種激素水平，如腎上腺素、胰島素、甲狀腺激素等，以診斷內分泌系統疾病。

血液疾病診斷：生化免疫分析儀可以檢測血紅蛋白、白細胞計數、血小板計數等血液學指標，以診斷各種血液疾病。

免疫系統疾病診斷：生化免疫分析儀可以檢測免疫球蛋白、免疫球蛋白分子量、免疫球蛋白電泳等指標，以診斷免疫系統疾病。

藥物監測：生化免疫分析儀可以檢測血液中藥物的濃度，以評估藥物治療的效果和安全性。

生物化學指標監測：生化免疫分析儀可以檢測肝臟功能、腎臟功能、電解質平衡等生物化學指標，以評估器官功能。

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